しかし2回目からはクエリーキャッシュが働いて正確な値がとれない
その場合はクエリーキャッシュを削除する
show status like "%Qcache%";で確認してみる。

mysql> RESET QUERY CACHE;をおこなう

確認すると減っているのが確認できる。
(アクセスがあるサーバなので消してすぐにキャッシュさせていますが。。)

MySQL 5.1 リファレンスマニュアル 4.13.4. クエリ キャッシュのステータスと保守
はじめてのMySQLチューニング 第6回:query_cache_sizeの違いによるパフォーマンス比較